自动档的昂科拉和凯越变速箱是不一样的。昂科拉ENCORE变速箱方面，全进口的6速手动变速箱同样运用于新君威等车型，无疑能满足驾驶者的驾控需求。它罕见地为包括倒挡在内的所有挡位配备同步器，换挡更迅速直接，全新双锁杆式系统也能提供更精准的换挡手感。同时，在驾驶员信息中心新增EcoDrive节能小助手，通过绿色shift换挡指示来提醒驾驶者在最省油的转速下进行换挡，提升燃油经济性，最低综合油耗可达6.9L/100km，创下同级新低。追求舒适驾驭感受的客户还有一款全新一代6速手自一体变速箱可供选择。它集合了独特的行星齿轮组与单一轴设计等多项通用专利技术，通过D挡怠速经济模式和更宽的齿比范围，让昂科拉ENCORE成为同级低油耗的表率。
